Судоводительский факультет готовит инженеров по специальностям «Судовождение» (специализация «Промысловое судовождение») и «Организация перевозок и управление (на морском транспорте)». Факультет имеет в своем составе пять кафедр: судовождения (выпускающая по специальности «Судовождение»), заведующий кафедрой доцент, к.т.н. Букатый В.М., организации перевозок [выпускающая по специальности «Организация перевозок и управление (на морском транспорте)»], заведующий кафедрой доцент, к.т.н. Мейлер Л.Е., технической эксплуатации судна и промышленного рыболовства, заведующий кафедрой профессор, д.п.н. Бугакова Н.Ю., математики, заведующая кафедрой профессор, д.п.н. Бокарева Г.А., английского языка, заведующая кафедрой - доцент, к.ф.н. Сопова Э.С. Обучение осуществляется по дневной и заочной формам в том числе по заочной сокращенной форме (для лиц, имеющих среднее профессиональное образование) на госбюджетной и коммерческой основах. Срок обучения по очной форме 286 недель (5,5) лет из них не менее 66 недель практического обучения на судах. По заочной форме срок обучения 6,5 лет и по заочной сокращенной форме 4,5 года. Кроме того, на факультете организованы и действуют дополнительные коммерческие образовательные услуги: «Получение второго высшего образования по специальности «Судовождение» (специализация «Морское судовождение» на базе высшего образования по специальности «Техническая эксплуатация судового радиооборудования» – срок обучения 2,5 года и «Получение второй специализации «Морское судовождение» на базе высшего образования по специальности «Судовождение» со специализацией «Промысловое судовождение» - срок обучения 15 недель.

На специальности судоводительского факультета принимаются лица со средним образованием, годные по состоянию здоровья для работы на морских судах и прошедшие конкурсный отбор на вступительных экзаменах – успешнее других сдавшие экзамены по математике, физике и русскому языку.

Судоводительский факультет имеет современную учебно-лабораторную базу, включающую в себя оснащенные необходимой техникой лаборатории (технических средств судовождения, промысловой гидроакустики, автоматизации судовождения, теории и устройства судна, промышленного рыболовства, грузоведения, перегрузочных средств), кабинеты (мореходной астрономии, навигации, навигационной гидрометеорологии, математики), тренажеры (рыбопромысловый, радиолокационный, по управлению судном, штурманский) и три компьютерных класса.